银行工程保函是保证金等货币性债务的一种担保形式，对于保证金的收取和使用起到重要的作用。一旦保函丢失，可能会给双方带来不必要的麻烦和损失，因此需要及时处理。
首先，如果发现银行工程保函丢失了，应该立即通知相关的银行，告知情况并申请重新开具。在此过程中，需要提供相关的证据和资料，以便银行进行核实和处理。
其次，可以向保函开立的单位或个人索要相关的证明文件，以证明保函的真实性和有效性。这样可以在一定程度上减少因保函丢失而带来的问题和纠纷。
此外，可以向银行申请挂失，即将原有的保函作废，并重新开具一份新的保函。这样可以避免原有保函被他人恶意使用，对双方造成不必要的损失。
总之，一旦银行工程保函丢失了，及时处理并补办是非常重要的。只有在保障双方利益的前提下，才能有效化解因此而产生的问题。
